Real Madrids midtbanespiller Eduardo Camavinga (21) pådrog sig en ledbåndsskade i knæet under træningen med Frankrig, mens klubkammeraten Aurelien Tchouameni (23) fik et stressbrud i venstre fod i sejren over Barcelona i sidste måned.
Paris St. Germain-midtbanespilleren Warren Zaire-Emery (17) er ude resten af året, efter at han pådrog sig en ankelskade i sin debut for Les Bleus.
"Vi havde ret. Vi vidste det. Vi sagde det. Gentagne gange. Og sagde det igen," sagde UNFP i en udtalelse sent onsdag.
"Men selvom de øverste ledere er forpligtet til at lytte til os, er det sjældent, at de rent faktisk lytter til os."
UNFP sagde, at det var "på høje tid at gennemføre en grundig reform af kalenderen".
"Hvis perioden efter VM har retfærdiggjort alle dem, der opfordrer til en revision af kampprogrammet, er dette kun de første tegn på en endnu dybere krise, der også vil ende med at skade spillet," tilføjes det.