Den 24-årige pådrog sig skaden i lørdagens 2-0 nederlag i FA Cup-kvartfinalen til Manchester City, som satte en stopper for Newcastles håb om sølvtøj i denne sæson. Botman går dermed også glip af Hollands kampagne ved EM 2024.
"Sven Botman vil blive opereret i næste uge efter at have pådraget sig en knæskade mod Manchester City," siger Newcastle i en udtalelse.
"En scanning har bekræftet, at han har pådraget sig en skade på sit korsbånd, og han forventes at være tilbage inden for seks til ni måneder.
"Vi ønsker dig en fuld og hurtig bedring, Sven."
Skader til nøglespillere har været en vigtig faktor i en skuffende sæson for Newcastle.
Med støtte fra den saudiske statsfond sluttede de på fjerdepladsen i Premier League i sidste sæson og nåede Champions League for første gang i 20 år.
Men The Magpies røg ud af Europa i gruppespillet, ligger nummer 10 i Premier League og har ikke formået at vinde deres første store trofæ siden 1969 i den hjemlige pokalturnering.