Polakken pådrog sig således en forstuvet ankel i Champions League-kampen mod FC Porto onsdag, meddeler den spanske klub på sin hjemmeside.
Barcelona meddeler ikke, hvornår Lewandowski forventes at være klar igen, men han er helt givet ude af besøget hos Granada i La Liga søndag.
Herefter venter Athletic Bilbao og Shakhtar Donetsk efter landskampspausen, inden det 28. oktober går løs mod ærkerivalen Real Madrid i sæsonens første El Clasico.
35-årige Lewandowski har i denne sæson lavet seks mål og fire oplæg i sine ti kampe for FC Barcelona, der er kommet glimrende fra land i sæsonen.
Otte ligakampe har givet 20 af 24 mulige point, og med to sejre af to mulige styrer Barcelona mod avancement fra Champions Leagues gruppespil for første gang i tre år.