Fra Salzburg kommer den 46-årige østriger Christoph Freund, der gennem otte år har besat samme stilling i klubben, der hører under Red Bull-paraplyen.
Det skriver Bayern München tirsdag på fodboldklubbens hjemmeside.
Freund blev ansat i Salzburg allerede i 2006, efter at han stoppede en mindre profileret karriere på banen. Først som team manager og siden i en koordinatorrolle.
Han har dermed været med i stort set alle de år, hvor klubben har været ejet af Red Bull. Det er i den tid blevet til blandt andet 14 mesterskaber, ni pokaltitler og seks gruppespil i Champions League.
Bayern München vandt i sidste sæson sit 11. mesterskab i træk. Men det skete efter en svingende sæson og med held i sprøjten.
Bayern startede sidste spillerunde på andenpladsen i Bundesligaen, men slog FC Köln på et mål i de sidste minutter og overhalede Borussia Dortmund, som snublede og spillede 2-2 mod Mainz.