Bundesligaklubben oplyser på sin hjemmeside, at parterne stopper samarbejdet med øjeblikkelig virkning.
Union Berlin var den helt store succeshistorie i Tyskland i den forgangne sæson, hvor holdet med Frederik Rønnow som fast målmand blev nummer fire og kvalificerede sig til Champions League.
Men efter sommerpausen er det mildest talt ikke gået efter planen for hovedstadsklubben.
Efter den seneste sejr over Darmstadt 26. august tabte holdet 12 kampe på stribe i alle turneringer.
I sidste uge fik Rønnow og holdkammeraterne et point i udekampen mod Napoli, men det blev fulgt op af et nederlag på 0-4 til Bayer Leverkusen i weekenden.
Den håbløse periode har betydet, at Union Berlin er sidst i både Bundesligaen og i sin Champions League-gruppe.
Urs Fischer har været træner for Union Berlin siden sommeren 2018 og var med til at rykke holdet op i sin første sæson i klubben.
Holdet overlevede i første sæson med en 11.-plads, og det blev fulgt op af slutplaceringer som nummer syv, fem og senest fire i Tysklands bedste fodboldrække.
Der er da heller ikke tale om, at Union Berlin nu smækker med døren, forklarer klubpræsident Dirk Zingler.
"Jeg understregede for nylig, at Urs Fischer er en fremragende træner, og det er jeg stadig fuldstændig overbevist om."
"Hans personlighed og succesfulde arbejde har formet klubben de seneste år og åbner mange muligheder for os," siger han til klubbens hjemmeside.
Ud over Rønnow er reserverne Jakob Busk og Mikkel Kaufmann på kontrakt i Union Berlin.